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医药集中统一管理。
宫廷医药机构御药房、安乐堂、生药库、王府良医所、地方医学教育机构、典药局等都和医药管理中枢太医院有着直接或者间接的联系。
与医药有关的事宜。
一般都经过太医院的协调处理而后实行。
太医院的工作受到礼部制约。
主要的功能是：
一、负责贯彻皇帝医药诏令，例如嘉靖二十年五月丁酉，京师疫疠流行，皇帝命太医院差官顺天府措置药物，设法给惠。太医院则遵照旨意，组织实事办理。
二、医生的征召、选任和罢黜。
三、将医官差派到各王府，全国各地，例如国子监、监狱、村镇等。
四、皇帝医疗服务，像是内府御药房的两班轮值，帝王的出巡需要医师外，皇子、宫妃、大臣、外宾等患病，也由太医院派良医去诊视。
五、医生的培养教育，明代中央没有专门的医学教育机构，所以培育医学生也由太医院负责，社会培养医生则由地方承担。
六、对其他医药机构的管理，太医院对御药房、生药库、安乐堂、惠民药局等机构制约，是通过委派医官的形式实现的。
苏玄出了门，在路上买了包子，边吃边朝太医院走去。
“幸亏太医院距离这里不远。”
“否则我的两条腿就要废了。”
苏玄心想。
“这里就是太医院吧。”
苏玄抬头看着这衙门。
衙门典雅稳重，做工讲究，青砖灰瓦，朱红色的大门三座，均是向西。
衙门黑漆书写太医院三字的朱色立额。
大门前为门役住房；内有大堂五间；左侧有南厅三间，是御医办公处所；右侧是北厅。
太医院附近衙署较多，也比较靠近皇宫，便于给皇室以及官员看病。
苏玄走上前。
守在门口的门役注意到了他，面色大惊，脚步往后退了一步，转身就跑进里面，边跑还边喊：
“来了！！”
“院丞大人来了！！”
喊声顿时惊动整个太医院。
苏玄：......
自己是不是被当成了什么洪水猛兽？
很快，乌泱泱一群人快步朝门口的方向走来。
为首的正是太医院一把手，身为院令的孙守真，孙守真身穿青色官袍，头戴乌纱帽，见到苏玄，面色大喜。
“苏大夫.....不对，苏院丞，我可终于等到你了！”
“这是葛景山同知，陆惟恭、杜天僖院判......”
孙守真为苏玄介绍着身边的人。
“苏院丞，这些天我们一直在等你，准备推广牛痘技术，另外，关于牛痘技术，我们有许多问题想要请教。”
孙守真一下子将苏玄拉入学术的讨论。
苏玄一一为孙守真等人解答，而后让孙守真等人安排人手去寻找患有牛痘的水牛。
一番寻找。
他们找到了患病水牛。
而后他们开始了一系列的人工培育、减毒、灭活等。
最终，他们得到了可以预防天花的牛痘疫苗！
太医院，牛痘疫苗研发间。
“成功了！”
孙守真等人狂热的看着成功研制出来的牛痘疫苗。
只要有牛痘疫苗，那么大明千万百姓再无惧豆疾、天花等病毒。
而接下来。
就是牛痘疫苗的推广。