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-003接触到活体有机物质时发生的增殖改变；Scp-003会从有机物质“取样”，并会试图与和最初的“样本”或“样本们”匹配的生物进行沟通。
在第二阶段中，Scp-003-1可能会暂停，减慢或改变其增殖，而且也会把无机及有机无生命元素转换为能够运作的类似结构，同时异常地改变它们的身体结构。
尽管第一阶段的增殖速率始终如一，但在第二阶段，只要Scp-003-1与活体有机物质保持接触，它的增殖速率便会跌落至原先的20%到90%。此百分比取决于与之接触的有机体的复杂程度；Scp-003-1似乎将大量维持运转的能量用于活体有机体的解析过程。
在每个增殖阶段中，Scp-003-2会释放辐射信号脉冲暂时抑制Scp-003-1的生长，或在Scp-003-1的温度超过100c时逆转其生长过程。类似的辐射已通过其他异常方法复制或记录。
Scp-003-1的生物学一直是广泛研究的课题。已经确定Scp-███、Scp-1512和Scp-2756的类似重要元素，后两者没有与Scp-003-1的进一步关联，未知两者间的关联，且没有完全了解（技术上，甚至所知比Scp-003-1少，感谢对Scp-003项目广泛的跨学术研究）。迄今，没有提出令人信服的、可以满意地解释Scp-003-1与这些Scp项目或其它联系的分析，也没有其外观除现代化技术外的联系（以及通过未知机制的潜在模拟）。
附录003-01：按照从对比数据分析以及对Scp-003-2符文的语言分析中获取的信息，m03-Gloria调查团设法在Scp-003与[数据删除]间建立了连接，用以分析其机能。Scp-003-1目前被认定拥有感知力，须随时与[数据删除]及作为结果的“副产物”保持至少一公里的距离。
附录003-02：m03-Gloria的行动加剧了Scp-003-2的功率损耗。在o5-10的命令下，m03-Gloria将继续执行。
附录003-03：在执行m03-Gloria的过程中，Scp-003-1的质量翻了一倍，并开始了结构上的快速增殖，其温度立刻恢复至100c。增殖与质量的增长持续了9分6秒，期间，Scp-003-2发出了持续辐射脉冲。Scp-003-1在3分39秒返回其正常状态以示响应。新的生长物分解成了粉末状残渣，现已回收供分析之用。其后两者终止了一切可识别的活动。Scp-003-2停止了活动，直到接上外来电源才恢复活动。Scp-003-2的符文散发出均匀的微光，在三（3）小时后才恢复正常的活性。现在若非借助由发电机003-III至Ix提供的外部电源，Scp-003-2已无法将收容区的温度维持在35c以上。
附录003-04：附录003-03提及的过程再次出现，Scp-003-1重新进入了生长状态。10分13秒后，Scp-003-2再次发出持续辐射脉冲。Scp-003-1一时停止生长，36秒后恢复了先前的生长速度。
Scp-003-1的质量达到原先的四倍时，它构造出了纹理清晰的外壳及躯体。在探查周遭环境，并转化了一部分环境后，Scp-003-1突破了收容，进入观察室，与在场的九名m03-Gloria成员进行了身体接触。Scp-003-1以迅速生长的附肢包围他们，然后在接下来的15分钟，Scp-003-1暂停了生长。待恢复后，Scp-003-1将自身结构中心部的零件重新排列，形成一个三米高的雌性人型生物，周身环绕的“触手”从它新近形成的“头发”和脊椎上伸出来，游移不定。而后Scp-0
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