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氏鱼的运动速度和灵敏度，这使得它在进化过程中渐渐输给了小小的鲨鱼和其他肉食鱼类；再加上泥盆纪末期地球的环境变化，最终使得他离开了生物繁衍进化的舞台。
经过泥盆纪后期灭绝事件，邓氏鱼完全灭绝，同时以邓氏鱼代表的“头骨外骨骼化”的盾皮鱼类全部灭绝，在海洋里科学家已经无法找到任何与其有血缘关系的后代。只有曾经见证了邓氏鱼3亿多年前的风采和辉煌的鹦鹉螺、蟑螂、腔棘鱼、七鳃鳗和现代鲨鱼等为数不多的活化石生物依然在今天生活着，而邓氏鱼所有发现的骨骼也早已在几亿年前就已成为化石，科学家们无法以从其骨骼里到提取dNA、并以克隆的方式让这种巨型食肉鱼类重现与世。不过，科学家们坚信，随着人类的不断努力，科技的持续发展，终有一天，会寻找和收集到更多该物种的化石样本，陆续提取和收集到完好的dNA，通过克隆的方式将这种已消失了3.6亿年的壮观古生物重新带回到这个世界。
作为脊椎动物出现之后的第一种超级掠食者，邓氏鱼最终在泥盆纪末期的大灭绝中消失，但是它们保存在地下的化石诉说着盾皮鱼类曾经的辉煌。博物馆中邓氏鱼的化石总会引起观众的驻足。